克莱蒙特学院的计算基础设施将受益于NSF第二批拨款

第二笔国家科学基金会赠款用于在克莱蒙特学院内建立区域计算基础设施, 被授予了南加州大学的一个团队，该团队与克莱蒙特大学的教职员工合作.

“这对南加州区域研究计算社区来说是个好消息! 除了我们去年获得的奖项science DMZ:实现更快数据传输的基础设施之外，这是在构建计算科学和工程基础设施区域联盟方面向前迈出的一大步,共同首席调查员byeong - do (BD) Kim说, 南加州大学高级研究计算中心副首席研究信息官和主任. 科学“DMZ”旨在允许经过批准的数据节点通过非常高速的连接彼此通信，这种连接绕过了防火墙等正常的网络安全措施. Los Nettos通过南加州大学获得了早期的拨款，用于为区域网络建立一个科学DMZ.

“校园网络基础设施(CC)区域计算:建立网络基础设施以打造南加州区域研究计算联盟”是一项999美元的补充赠款,970建立和支持高性能计算服务器，可以用于教师和学生的研究计算需求. CC项目投资于协调校园级网络和网络基础设施的改进, 创新, 科学应用和分布式研究项目的集成和工程.

“我们应用程序的优势来自于我们的‘科学驱动因素’,他们会提供支持信，分享他们研究的意义以及如何从计算资源中获益的细节,Aashita Kesarwani说, 他是HMC学术和研究计算服务电子游艺信誉排行榜的数据科学家.

来自教员的证词, 包括电子游艺信誉排行的学生(如下图), 描述与项目相关的挑战和机会.

• 生物学教授艾略特·布什 他的学生们已经开发出重建密切相关的微生物分支中水平转移事件历史的方法. 他说:“目前已有数十万个微生物基因组测序. 对于我们的方法，我们想到的一个应用是在整个生命树中系统地应用它. 要做到这一点，就需要访问高性能计算, 通过快速的网络连接，我们可以从NCBI和其他来源快速获取数据.”
• 计算机科学教授Geoff Kuenning 监督SNIA IOTTA跟踪库, 这是一个大型的科学数据仓库，主要托管在Harvey Mudd学院，自2007年以来，它一直向世界各地的研究人员提供文件系统跟踪的集合，并被超过580篇科学论文引用. 他说:“这个存储库目前包含22 TB的数据，而且还在不断增长. 它是世界上唯一可靠的, 长期收集这样的痕迹, 文件系统社区认为它是此类数据的“首选来源”. 互联网被用来将数据放入存储库中，并将其提供给研究人员. 将大量的研究成果转移到HMC或让研究人员下载数据供自己使用可能需要几天的时间. 因此, 增强的Internet连接不仅对存储库本身有巨大的好处, 也给了美国各地的存储研究人员.S. 在世界范围内.”
• 数学教授Susan Martonosi说 她的课题组利用大规模优化技术解决网络优化和资源配置的相关问题. 这项工作适用于秘密网络的拦截, such as terrorist or drug smuggling networks; contract negotiation for pediatric vaccines for low-income countries; and developing interventions to mitigate the propagation of fake news on social media. 她和她的研究人员为了灵敏度分析的目的，在数千个大型测试用例中实现和测试模型和算法. “能够访问高性能计算基础设施对完成这项工作至关重要,”Martonosi说.
• 化学教授Katherine Van Heuvelen说 她的学生研究酶是如何在还原脱卤过程中分解优先污染物的. 他们使用计算化学方法来模拟酶的反应途径，并设计出可以在实验室中进行这些反应的小分子. 这项工作的计算成本很高，而且依赖于本地机器和超级计算环境之间的快速数据传输.

基础设施需要几年的时间才能上线, 当完成, 会被克莱蒙特学院和其他南加州大学共享吗.

赠款是NSF为满足NSF社区日益增长的需求而作出的持续努力. “如今的校园面临着跨越多个层次的网络基础设施的挑战,NSF在其CC项目征求书中说, 满足科学研究和教育的需求远远超出了网络层的能力和服务, 并扩展到计算领域, 数据服务, 安全可靠的系统, 尤其是人类的专业知识, 协作和知识共享. 认识到科学进步和发现的“数据驱动”性质，使人们更加关注由NSF研究和教育界提出的数据挑战.”